根據拉姆薩公約（Ramsar Convention, 1971）第一條對濕地之定義：「不論天然或人為、永久或暫時、靜止泥沼地、泥煤地或水域所構成之地區，包括低潮時水深6公尺以內之海域。」
台灣四面環海，濕地資源豐富，目前共有國家重要濕地75處，涵蓋全台由北到南。濕地具有非常重要的功能與價值，是地球各生態系中生產力最高者之一，其豐富生物多樣性使之成為重要生物基因庫，是孕育新物種的演化平台，也是各種生物的繁衍棲息地。此外，濕地具有保水抑洪、淨化水質、穩定海岸、觀光遊憩與研究教育等功能外，可說兼具相當高的經濟與生態價值。

台東縣的濕地和台灣北部及西部相較，數量少很多，因此更為珍貴，尚未列入國家重要濕地的知本濕地，生態資源豐富，是水鳥在東部過境棲息重要的場所，清華大學水生物專家曾晴賢教授認為：「全世界的濕地，都因人為的干擾而縮小或消失之際，知本濕地卻因無人干擾而復活，並逐漸擴張還原，實在是個相當珍貴的案例。」但知本濕地因未列入國家重要濕地，開發壓力與日俱增，加上缺乏管理與維護，廢土、噪音、垃圾等污染問題時有所聞，四驅車輛任意闖入，有意無意的騷擾野生動物，必然對濕地生態產生影響，可惜的是，目前除台東鳥會在人力有限下，每季在知本濕地進行一次賞鳥活動外，長期調查資料非常缺乏。

本次計畫分別針對鳥類及植物進行長期生態監測，以建立對濕地基本現況的瞭解，並在未來對棲地復育或改善進行管理建議，累積詳實的基礎資料，更可以在將來運用在解說活動及帶領民眾進行環境教育。同時在冬季舉辦冬候鳥季，提供當地居民一個認識知本濕地的窗口，並瞭解此地的豐富生態與重要性。