內政部營建署96 年底公告臺灣75 處「國家重要濕地」，其中淡水河沿岸從挖子尾濕地、淡水河紅樹林濕地、關渡濕地、五股濕地與大漢新店濕地皆被評選為國家級重要濕地。而荒野保護協會長期關注五股濕地與挖子尾濕地，並於98 年接受營建署委託執行「台北縣98 年度國家重要濕地生態環境調查及巡守計畫」，計畫針對五股、挖子尾與大漢新店濕地進行基礎生態調查，並於五股與挖子尾擴大在地居民參與並成立巡守隊，成為未來守護濕地的生力軍。

本計畫分別針對五股、挖子尾與大漢新店濕地進行濕地生態調查，委請「觀察家生態顧問公司」團隊帶領鳥類、植物、昆蟲、水生生物、兩棲類、爬蟲類等主要指標項目進行生態普查，並參考行政院農業委員會特有生物研究保育中心出版「濕地生態系生物多樣性監測系統標準作業程序」協助建構濕地生態資料庫，而本次普查3 處濕地陸域動物調查共記錄到44 科87 種1,692 隻次的各類陸域動物，其中包括11 種台灣特有(亞)種和2 種保育類野生動物；而植物部分共調查到維管束植物57 科131 屬170 種，其中包括2 種稀有植物；再依據3 處濕地生態普查結果，加上不同水生生物與地理差異，持續進行鳥類、蝴蝶及蜻蜓類、爬蟲類與水質調查等定期調查。另，本計畫亦針對五股與挖子尾兩處濕地進行棲地生態巡守，五股部份由成員多為附近居民組成之「五股濕地河川巡守隊」進行不定期生態巡守紀錄；而挖子尾部分由於未有固定人力編組，則由荒野原志工群組進行巡守紀錄工作，希望未來能結合在地居民成立巡守隊。最後，本計畫也將生態調查資料進一步整理分析，同時建立回報機制以利巡守隊員回報巡守監測之資料與狀況，並將上述濕地調查與巡守監測分別建立資料庫上網公開，以利大眾取閱使用。

本年度所進行之基礎生態調查與巡守監測等工作已獲得初步資料與系統的建置，未來應就物種保育、棲地復育與生態教育三面向繼續深入研究；其中物種保育部份未來應持續進行生態調查以累積基礎生態資料，並進一步依照營建署SOP 調查與資料庫建置方式，讓這些調查數據更有科學性及共通性；棲地復育部分則發現五股濕地中原有淡水池塘因88 水災造成破洞，後續應進行修補作業以維護溼地內珍貴淡水資源及其棲地多樣性；生態教育部分未來則應舉辦更多的自然體驗活動與生態課程，讓周邊社區、學校更認識並參與濕地守護，以真正落實社區參與。