新竹市沿海的泥灘地是北台灣最大的海濱濕地，生態資源豐富，千餘公頃潮間帶所孕育的大量蝦蟹螺貝，吸引大批水鳥，據統計記錄的鳥類已逾三百種、螃蟹超過五十種。尤其介於客雅溪口至南港無名溝之間的香山潮間帶，已於1996 年國際拉薩姆公約組織會議中被正式列為「東亞水鳥保護網」的一環。在各方期盼與努力之下，新竹市政府終於向行政院農業委員會提報並於90 年6 月8 日經該會正式公告成立「客雅溪口及香山溼地野生動物重要棲息環境」，竹市府進一步擬定保育計畫後，於90 年12 月14 日將之劃定為「新竹市濱海野生動物保護區」，其目標除保護當地珍貴動植物相以免遭到不當人為開發利用、建立保護區內之動植物資源等資料以外，更將積極實施復育計畫，確保區內遺傳、物種、生態系之多樣性。香山濕地原具有豐富多元的棲地型態，包括沙質、泥質、礫質、河口及紅樹林等類型。其中紅樹林棲地分別在客雅溪口北側以及海山罟。惟80 年完工的新竹漁港突堤效應已逐漸顯現，又87 年間不明人士在客雅溪以南至海山漁港間插植紅樹林苗，今已大面積密集成長且大量繁殖擴張領地，致使香山濕地沙質棲地以及泥灘的沙泥比迅速遞降，昔日盛產的文蛤、雙線血蚶…等貝類已愈來愈難找到。早在91 年度本府相關委託調查研究案已經注意到紅樹林在香山濕地可能造成的危害。中研院動物所陳章波研究員在「新竹市濱海野生動物保護區生態保育對策及紅樹林調查研究」有下列建議事項：

（1）目前分布在新竹市沿海的紅樹林主要在客雅溪口、大庄溪口與海山漁港南岸至鹽水港溪北岸之間，總面積（不包括 客雅污水處理廠預定地內的紅樹林）約為21.57 公頃，紅樹林面積有持續擴張的趨勢。對於保護區內的紅樹林管理，在不影響排水的前提下，讓成林區自然繁衍的小苗順著水道生長即可，無須再進行人工栽植小苗。

（2）紅樹林與台灣招潮蟹雖然都是生長在高潮線地帶，但台灣招潮蟹對棲地的需求在空間位置或底質物理條件都比紅樹林來得窄，紅樹林的出現會改變台灣招潮蟹棲地的物理化學性質。因此，必須在保護區內的海山漁港南岸及海山罟兩處劃設台灣招潮蟹保留區，其外圍須設置緩衝帶，靠近緩衝帶或緩衝帶之內的紅樹林都必須移除，以確保台灣招潮蟹棲地的完整性。

（3）大庄溪口河道應保持類似喇叭狀的宣洩開口，出海口處的人工栽植紅樹林應移除，對於新著生的小苗也應定期清除，避免紅樹林增長而增加泥沙淤積的速率，造成河口灘地的高程增加，使河川水量排放困難，有淹水之虞。