嘉義縣因地形多元條件造就豐富多樣性的特色，除享譽中外的阿里山之外，由海濱、平原、丘陵、高山等四大地景衍生的多元風貌本質。地理位置西濱台灣海峽，東側多山，在地形分區上為東部係屬中央山系，地勢向西漸緩。縣內主要河川皆源自東側高山，向西流入臺灣海峽，自北至南依序為北港溪、朴子溪及八掌溪。北回歸線穿越本縣水上鄉，為熱帶圈及亞熱帶圈的界線。

本縣位於嘉南平原的地理中心，四季氣候宜人，涵育豐富的自然資源，縣境內中高海拔山區，平原田野風光到海岸濕地，各種類型的棲地環境，擁有豐富的自然棲地與野生動、植物資源。

嘉義縣位列國家級的重要濕地有：鰲鼓濕地512公頃、好美寮濕地1,171公頃、布袋鹽田濕地721公頃、八掌溪口濕地635公頃（範圍含括台南縣轄內）、嘉南埤圳濕地1,383公頃（範圍含括台南縣轄內）等5處小計4,422公頃。地方級包括：椬梧濕地1,857公頃（範圍含括雲林縣轄內）。八掌溪中游濕地363公頃（範圍含括嘉義市轄內）等2處小計2,220公頃，合計6,642公頃。