本計畫依據內政部「99年度國家重要濕地生態環境調查及復育計畫申請補助須知」提出申請，希望透過本計畫之執行，具體落實北門濕地之生態監測，符合生物多樣性保育理念之濕地生態監測及教育解說計畫，以達到濕地生態永續、二氧化碳減量、省能、在地化參與、環境綠美化等目標。

北門濕地位於急水溪出海口，北起急水溪北岸堤防，南至將軍溪口北側，東至五王大橋及省道台17公路 (包括東邊的舊鹽田)，西側海域至等深線6公尺處，包含北門潟湖、北門港沙洲；北門交流道附近部分鹽灘為未定範圍(如圖1)。

台南縣北門濕地位在急水溪北堤與將軍溪之間，包括了急水溪出海口、海汕洲南端、王爺港汕及陸上魚塭區以及其所圍成的潟湖、北門鹽灘地，幾乎涵蓋了整個台南縣北門鄉的海岸，濕地生態豐富且完整。現在的北門鹽田包括原來的王爺港鹽田、蚵寮鹽田、洲北鹽田、中洲鹽田及現已復晒做為觀光的井仔腳鹽田。海岸堆積作用旺盛，形成潮汐灘地(略有海岸侵蝕)、潟湖、離岸沙洲、新月丘、鯨背丘等豐富地形地理景觀。