曾文溪口濕地與七股鹽田濕地包含曾文溪口北堤潮間帶、七股潟湖及七股鹽田等部分。七股潟湖面積約一千六百公頃，是台灣面積最大且最完整的潟湖。此瀉湖孕育了豐富的水生生物且亦是繁殖的重要棲地。此外，七股鹽田濕地所在的曾文溪口及頂山棲地，每年十月有度冬候鳥於此棲息。例如瀕絕的候鳥黑面琵鷺及黑嘴鷗等。
黑面琵鷺（Platalea minor）為廣受全球保育界重視的珍稀瀕危鳥類，98年11月初黑面琵鷺族群總數超過一千餘隻，目前台灣為黑面琵鷺已知的最主要度冬區，來台度冬的族群數量約佔其總數的百分之七十，因此台灣實應在全球黑面琵鷺保育，扮演無可取代的重要角色。由此可見，七股鹽田濕地不僅有豐富的魚蝦蟹貝類外，更是冬候鳥度冬棲息的天堂。
為廣泛且持續進行相關濕地環境保育、復育與生態調查，具體落實環境基本法，將藉本補助計畫，提出國家重要濕地生態環境監測、地景復育及復育計畫之構想，以改善現有環境。
由『縣府』、『國立成功大學_海洋生物及鯨豚研究中心』與『民間社團_台灣黑水溝保育學會』等三方共同建設與經營，在黑面琵鷺棲息地及重要棲息地結合自然生態資源、學術研究、環境監測與地景復育營造，利用地方特色與地區資源，發展兼顧生態保育與產業特色的生態園區。在政府與專家學者之監督下，營造一個包括生態旅遊、產業文化保存、野生動植物保育等的生態保育地，並建構完整及長久型研究與監測調查計畫，不但建構出完整及永續利用之生態環境，且能帶動當地的生態旅遊事業，將是一個雙贏的計劃。

協助縣府將曾文溪口濕地與七股鹽田濕地，建設成為國內外知名的生態保育基地，提供自然教育、科學研究、休閒旅遊等多功能的效益，並推動生態休閒產業，注重「生態、生產、生活」，使「三生」的理念能夠於日常生活中落實，達到全民共同進行保育、珍惜本土生態資源的目標。

環境經營兼顧生態保育並進的環境維護參考模式。並以現有之保護區生態資料為基礎進行監測調查，並能促使環境生態敏感地帶得到適當的保護，生物多樣性的功能得以彰顯。

建立環境經營兼顧生態保育並進的環境維護參考模式，並以現有之濕地生態資料為基礎進行生物監測調查、，以利民眾、學校鄉土教學認識濕地動物棲息地及生態系維護之重要性，以協助政府進一步經營管理重要生態環境，並能促使環境生態敏感地帶得到適當的保護，生物多樣性的功能得以彰顯。